La OET mantiene tres estaciones biológicas en Costa Rica

Las tres estaciones biológicas están afiliadas a la Organization of Biological Field Stations (OBFS) con el fin de promover el intercambio de profesionales en investigación biológica y educación. Además, se promueven las visitas de científicos entre las estaciones biológicas de la OET en Costa Rica y las del Smithsonian Tropical Research Institution en Panamá, así como la constante comunicación entre los investigadores.

La Selva	Localizada en las llanuras del Atlántico, es reconocida internacionalmente por sus instalaciones de primera para la investigación en el bosque lluvioso tropical.
Las Cruces	En el Pacífico Sur de Costa Rica, admirada por sus extensas colecciones de palmas, bromelias, plantas de Costa Rica en peligro de extinción y un mosaico de bosque lluvioso premontano.
Palo Verde	Situada en las tierras bajas del Pacífico Norte y conocida por su bosque seco deciduo, sus lagunas salobres y sus extensos humedales.